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跨市分支机构企业所得税如何申报
非独立核算的分公司，每月的收入费用不需上报总公司，申报所得税时，除本公司应缴的所得税外，还需加上总公司分配比例表中分配给本分公司的应纳税所得额和所得税额，报送的材料中还应附总公司的分配比例表。
独立核算的分公司，需在总公司当地税务机关备案该分公司为独立核算的性质，办理备案手续后，分公司申报所得税时只需申报本分公司所得税，不需提供总公司利润分配比例表。
（登记时未明确公司性质为独立核算的分公司，一般情况下税务机关是默认为非独立核算的。非独立核算的分公司可在第1次申报（预缴）所得税时，向相关税务相关申请转为独立核算。）
三级分支机构企业所得税，逾期未申报，如何处理
根据国家税务总局关于印发《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》的公告（国家税务总局公告2012年第57号）：
第四条 总机构和具有主体生产经营职能的二级分支机构，就地分摊缴纳企业所得税。
二级分支机构，是指汇总纳税企业依法设立并领取非法人营业执照（登记证书），且总机构对其财务、业务、人员等直接进行统一核算和管理的分支机构。
第五条 以下二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税：
（一）不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等汇总纳税企业内部辅助性的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
（二）上年度认定为小型微利企业的，其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。
（三）新设立的二级分支机构，设立当年不就地分摊缴纳企业所得税。
（四）当年撤销的二级分支机构，自办理注销税务登记之日所属企业所得税预缴期间起，不就地分摊缴纳企业所得税。
（五）汇总纳税企业在中国境外设立的不具有法人资格的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
根据以上规定，三级分支机构不就地缴纳企业所得税，且为2008年1季度企业所得税，根据征管法的规定，早就过了5年的追溯期，估计是税务局的征收管理系统存在问题。
跨市分支机构企业所得税如何申报？跨市分支机构企业所得税的申报，虽然都是在总公司所在地报税，但是会计学习资料在这里要提醒大家，一定要确定的是该分支机构是否是独立核算的，因为准备的资料是不一样的。
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